上海交通大學醫學院的住院醫師規範化培訓工作起步較早。早在2004年，原上海第二醫科大學就專門成立了校臨床住院醫師規範化培訓工作領導小組和專家委員會，由醫院管理處負責此項工作的日常管理，並相應製訂了一係列住院醫師規範化培訓工作方案和製度。2006年起，所有進入交大醫學院各附屬醫院從事臨床工作的住院醫師，不論學曆高低，全部納入培訓範疇，統一培訓標準及目標要求，明確規定了住院醫師培訓分為2個階段，第一階段培訓3年，第二階段培訓2年。並將合格與否作為職稱聘用的必備條件，對提高住院醫生臨床工作技能，發揮了很好的推動作用。

2010年，上海市將建立住院醫師規範化培訓製度作為貫徹落實國家醫改方案的基礎性工作加以重點推進，在全市統一實施住院醫師規範化培訓。交大醫學院作為醫學人才培養的高地，緊緊圍繞國家及上海市衛生計生科教工作要點，將畢業後醫學教育之住院醫師規範化培訓、專科醫師規範化培訓、全科醫學人才培養、醫教協同深化臨床醫學人才培養改革納入學校的重點工作。在既往開展住院醫師規範化培訓工作的基礎上，完善各項培訓管理製度、加強培訓管理工作、提升管理效能，以教學平台建設、培訓質量督導、年度考核、師資培訓、醫教協同、國際交流等為抓手，形成統一的標準和要求，提升醫學院畢業後醫學教育的整體培訓質量，逐步形成醫學院畢業後醫學教育的品牌。

目前，醫學院共有5家附屬醫院獲批國家級全科醫師規範化培訓醫院，10家附屬醫院獲批國家級住院醫師規範化培訓醫院，12家附屬醫院獲批上海市住院醫師規範化培訓醫院。年均招錄住院醫師學員844名，占全市招錄的35%。截至2016年，共培訓學員5249名，累計培訓合格住院醫師3137名，占全市培訓合格住院醫師總數的40%。

2013年起，根據上海市統一部署，啟動專科醫師規範化培訓工作，醫學院各附屬醫院已獲批201個專科醫師規範化培訓基地，累積招錄專科醫師1700多名，首批培訓合格239人，占全市50%以上。

各部門主要工作職能：

• 畢業後醫學教育委員會

  統一領導醫學院畢業後醫學教育工作；製訂醫學院畢業後醫學教育工作發展戰略、規劃；審定醫學院畢業後醫學教育有關政策。下設畢業後醫學教育辦公室。

• 畢業後醫學教育專家委員會

  參與研究和製訂醫學院畢業後醫學教育工作發展戰略、規劃及有關政策；負責製定各專業培訓標準和考核標準等；審定培訓、考核的實施方案和細則；指導和檢查各培訓基地的培訓工作。下設各培訓專業專家組。

• 畢業後醫學教育辦公室

  在醫學院畢業後醫學教育委員會領導下具體執行畢業後醫學教育日常管理工作；統一指導、協調、評估各培訓基地的住院醫師規範化培訓、專科醫師規範化培訓工作；組織實施教學平台建設、培訓質量督導、臨床技能考核、師資培訓等各項工作。辦公室設在醫院管理處。